Briar ve Bramble, gizemli koşullar nedeniyle çok genç yaşta annelerini kaybeder. Yıllar sonra, yaşlı bir dişi ayının ortaya çıkmasıyla birlikte, Ayı Kardeşler gerçeği kesin olarak öğrenmeye kararlıdır. Hikaye, doğayı korumaya çalışan iki ayı kardeşi, Briar ve Bramble'ın etrafında döner. Bu filmde ayılar, tehlikeli bir teknoloji şirketi olan N-Gene'e karşı mücadele eder. Şirket, doğayı yok etmek ve ormanları talan etmek için ileri teknoloji kullanmaktadır.